Le Service du contrôleur du 3 GSS, situé au deuxième étage de la bâtisse J-7, fournit au BFC Gagetown et à toutes les unités connexes des services en matière de gestion des ressources et de gestion financière. Le Service a un effectif qui se compose de sept militaires et cinq civils.
Il offre entre autres des services de comptabilisation des coûts, de recouvrement, d'information de gestion des ressources, de distribution des chèques de paie au personnel civil, de comptes créditeurs ainsi que d'information sur les ressources financières (budget et coordination des CA). Le Service du contrôleur du 3 GSS est également doté d'une cellule SCGF (service de dépannage, IPO et formation).